Permintaan terhadap kontena dalam perdagangan telah meningkat dari semasa kesamasa kerana mempunyai bentuk yang tetap dan mudah diurus. Untuk memastikan setiap kontena dapat dikendalikan dengan sempurna dan bekesan satu sistem pengurusan yang baik perlu disediakan. Kajian ini dibuat untuk menganalisakos pengangkutan kontena melalui laut yang melibatkan kos pengurusan dipelabuhan dan kos pengangkutan menggunakan kapal. Kajian kes bagi projek ini adalah Pelabuhan Johor di Pasir Gudang. Dalam kajian ini, semua kos yang terlibat dalam setiap langkah pengurusan akan dikenalpasti untuk dianalisa. Siakhir kajian, cadangan satu sistem pengurusan yang sesuai dengan kos yangoptima akan dibuat supaya pelabuhan dapat memberikan perkhidmatan akan dibuat supaya pelabuhan dapat memberikan perkhidmatan ditahap paling tinggi pada kadar kos yang paling minima dalam pengendalian kargo konena khususnya di Pelabuhan Johor.